Skip directly to search Skip directly to A to Z list Skip directly to navigation Skip directly to page options Skip directly to site content
HuGE Navigator|Phenopedia|PHGKB

Phenopedia


Brain Neoplasms

584 genes has been reported with Brain Neoplasms
[Click Sort to re-sort the table]
Associated Gene
Total Publication
Meta-analysis Publication
    IDH1 Genopedia 167 8
    EGFR Genopedia 117 4
    TP53 Genopedia 98 5
    IDH2 Genopedia 65 0
    TERT Genopedia 55 5
    BRAF Genopedia 47 3
    MGMT Genopedia 47 8
    CDKN2A Genopedia 26 1
    XRCC1 Genopedia 26 7
    KRAS Genopedia 24 2
    GSTT1 Genopedia 22 6
    GSTP1 Genopedia 21 4
    RTEL1 Genopedia 20 3
    PTEN Genopedia 20 1
    GSTM1 Genopedia 19 4
    ATRX Genopedia 16 0
    PIK3CA Genopedia 15 1
    XRCC3 Genopedia 15 5
    H3F3A Genopedia 15 1
    ERCC2 Genopedia 15 6
    ERCC1 Genopedia 14 6
    PHLDB1 Genopedia 14 1
    ERBB2 Genopedia 12 1
    CCDC26 Genopedia 12 2
    AIP Genopedia 12 0
    PDGFRA Genopedia 11 0
    EGF Genopedia 11 2
    MTHFR Genopedia 11 2
    MDM2 Genopedia 10 1
    ALK Genopedia 10 2
    FGFR1 Genopedia 9 1
    IL4R Genopedia 9 2
    CCND1 Genopedia 9 2
    XRCC4 Genopedia 8 0
    IL13 Genopedia 8 1
    MEN1 Genopedia 8 0
    CDKN2B Genopedia 8 0
    CTNNB1 Genopedia 7 2
    NRAS Genopedia 7 1
    RB1 Genopedia 7 0
    VEGFA Genopedia 6 0
    MSH2 Genopedia 6 0
    KDR Genopedia 6 0
    IL10 Genopedia 6 0
    COX8A Genopedia 6 1
    NQO1 Genopedia 5 0
    PARP1 Genopedia 5 3
    CDKN2B-AS1 Genopedia 5 0
    AKT1 Genopedia 5 1
    IL4 Genopedia 5 0
    HLA-DRB1 Genopedia 5 0
    MLH1 Genopedia 5 0
    LIG4 Genopedia 5 0
    ATM Genopedia 5 0
    NF1 Genopedia 5 0
    PON1 Genopedia 5 0
    PRKDC Genopedia 4 0
    ABCB1 Genopedia 4 0
    NBN Genopedia 4 0
    RAF1 Genopedia 4 0
    SOD2 Genopedia 4 0
    XRCC5 Genopedia 4 0
    APEX1 Genopedia 4 0
    HIF1A Genopedia 4 0
    HLA-A Genopedia 4 0
    GSTM3 Genopedia 4 0
    MSH6 Genopedia 4 0
    GNAS Genopedia 4 0
    ERCC5 Genopedia 4 2
    NAT2 Genopedia 4 0
    CDKN1A Genopedia 3 0
    CDKN1B Genopedia 3 0
    EME1 Genopedia 3 0
    DRD2 Genopedia 3 0
    ACE Genopedia 3 0
    CYP1A1 Genopedia 3 0
    CHEK2 Genopedia 3 0
    EPHX1 Genopedia 3 0
    ALAD Genopedia 3 0
    ERCC4 Genopedia 3 0
    GPX1 Genopedia 3 0
    GLTSCR1 Genopedia 3 0
    HLA-B Genopedia 3 0
    HLA-DQB1 Genopedia 3 0
    APOE Genopedia 3 0
    NOS1 Genopedia 3 0
    OGG1 Genopedia 3 1
    MTR Genopedia 3 0
    MMP1 Genopedia 3 0
    MTRR Genopedia 3 0
    MIR146A Genopedia 3 0
    MIR149 Genopedia 3 0
    KIT Genopedia 3 0
    RAD52 Genopedia 3 0
    BRCA1 Genopedia 3 0
    FUBP1 Genopedia 3 0
    TERC Genopedia 3 0
    SMARCA4 Genopedia 3 0
    BRCA2 Genopedia 3 0
    RAD51 Genopedia 3 0
    RET Genopedia 3 0
    PMS2 Genopedia 3 0
    BCOR Genopedia 2 0
    PDCD1 Genopedia 2 0
    PDE11A Genopedia 2 0
    KIAA1549 Genopedia 2 0
    PTPN11 Genopedia 2 0
    PRKAR1A Genopedia 2 0
    MAP2K7 Genopedia 2 0
    BCL2 Genopedia 2 0
    LIG1 Genopedia 2 0
    PTCH1 Genopedia 2 0
    BCORL1 Genopedia 2 0
    SMARCB1 Genopedia 2 0
    ROS1 Genopedia 2 0
    SOD3 Genopedia 2 0
    ABCG2 Genopedia 2 0
    QKI Genopedia 2 0
    CCND2 Genopedia 2 0
    CD163 Genopedia 2 0
    ACYP2 Genopedia 2 0
    TLR4 Genopedia 2 0
    TSC1 Genopedia 2 0
    TSC2 Genopedia 2 0
    XRCC2 Genopedia 2 0
    OBFC1 Genopedia 2 0
    CXCR4 Genopedia 2 0
    SLC7A7 Genopedia 2 0
    CAT Genopedia 2 0
    ADAM33 Genopedia 2 0
    HIST1H3B Genopedia 2 1
    CASP8 Genopedia 2 0
    IL12B Genopedia 2 0
    ITGB3 Genopedia 2 0
    MIR196A2 Genopedia 2 0
    MYB Genopedia 2 0
    MYBL1 Genopedia 2 0
    MMP2 Genopedia 2 0
    MMP3 Genopedia 2 0
    MMP7 Genopedia 2 0
    MMP9 Genopedia 2 0
    NOS2 Genopedia 2 0
    NOS3 Genopedia 2 0
    NF2 Genopedia 2 1
    IGFBP3 Genopedia 2 0
    IGF1 Genopedia 2 0
    HLA-C Genopedia 2 0
    GNAI2 Genopedia 2 0
    CIC Genopedia 2 0
    FLT3 Genopedia 2 0
    Alk Genopedia 2 0
    MTOR Genopedia 2 0
    ABL1 Genopedia 2 0
    XRCC6 Genopedia 2 0
    GLI2 Genopedia 2 0
    EML4 Genopedia 2 0
    ERCC6 Genopedia 2 0
    AKT2 Genopedia 2 0
    ESR1 Genopedia 2 0
    EFEMP1 Genopedia 2 0
    ZHX2 Genopedia 2 0
    CHAF1A Genopedia 2 0
    CYP3A5 Genopedia 2 0
    DDX3X Genopedia 2 0
    COMT Genopedia 2 1
    CDK4 Genopedia 2 0
    MPHOSPH6 Genopedia 1 0
    CDK6 Genopedia 1 0
    OLIG2 Genopedia 1 0
    CTLA4 Genopedia 1 0
    WDR65 Genopedia 1 0
    ZBTB46 Genopedia 1 0
    VTI1A Genopedia 1 0
    KIF18B Genopedia 1 0
    RUNDC1 Genopedia 1 0
    KCNG3 Genopedia 1 0
    Pik3ca Genopedia 1 0
    ZNF384 Genopedia 1 0
    DRD5 Genopedia 1 0
    EBF1 Genopedia 1 0
    Mos Genopedia 1 0
    DMBT1 Genopedia 1 0
    CTSZ Genopedia 1 0
    CYP1B1 Genopedia 1 0
    CYP3A7 Genopedia 1 0
    CYP2C8 Genopedia 1 0
    CYP2D6 Genopedia 1 0
    CYP2E1 Genopedia 1 0
    RAD51L3-RFFL Genopedia 1 0
    RTEL1-TNFRSF6B Genopedia 1 0
    RAD50 Genopedia 1 0
    LRPPRC Genopedia 1 0
    ARFRP1 Genopedia 1 0
    HOTAIR Genopedia 1 0
    TRAP Genopedia 1 0
    AOS Genopedia 1 0
    ALL1 Genopedia 1 0
    CHRNA3 Genopedia 1 0
    Braf Genopedia 1 0
    PKD1L2 Genopedia 1 0
    IL22RA2 Genopedia 1 0
    LRIG3 Genopedia 1 0
    CCR5 Genopedia 1 0
    ZPBP2 Genopedia 1 0
    COL1A1 Genopedia 1 0
    Cyp2b10 Genopedia 1 0
    CDKN2C Genopedia 1 0
    NMUR1 Genopedia 1 0
    TNIP1 Genopedia 1 0
    TUBB3 Genopedia 1 0
    SLC30A9 Genopedia 1 0
    IPO8 Genopedia 1 0
    ATG7 Genopedia 1 0
    SSSCA1 Genopedia 1 0
    Scrib Genopedia 1 0
    POMT1 Genopedia 1 0
    STAG2 Genopedia 1 0
    CEACAM3 Genopedia 1 0
    KDELR2 Genopedia 1 0
    CHEK1 Genopedia 1 0
    CHI3L1 Genopedia 1 0
    STK38L Genopedia 1 0
    PDXDC1 Genopedia 1 0
    FOXO1 Genopedia 1 0
    EPB41L3 Genopedia 1 1
    FGFR3 Genopedia 1 0
    FGFR4 Genopedia 1 0
    IKZF3 Genopedia 1 0
    R3HDM2 Genopedia 1 0
    FCER1A Genopedia 1 0
    MARCH8 Genopedia 1 0
    ZSCAN23 Genopedia 1 0
    FEN1 Genopedia 1 0
    ETFA Genopedia 1 0
    ETV6 Genopedia 1 0
    EWSR1 Genopedia 1 0
    F13A1 Genopedia 1 0
    ALDH3A1 Genopedia 1 0
    PTK2B Genopedia 1 0
    FAT1 Genopedia 1 0
    ERBB3 Genopedia 1 0
    ERBB4 Genopedia 1 0
    AHR Genopedia 1 0
    AIF1 Genopedia 1 0
    SLC39A11 Genopedia 1 0
    GNAI1 Genopedia 1 0
    GLI3 Genopedia 1 0
    RAD54B Genopedia 1 0
    Mapk1 Genopedia 1 0
    NEIL2 Genopedia 1 0
    GFAP Genopedia 1 0
    GH1 Genopedia 1 0
    GHR Genopedia 1 0
    ABL2 Genopedia 1 0
    MLH3 Genopedia 1 0
    DKK3 Genopedia 1 0
    KCNH5 Genopedia 1 0
    GLS2 Genopedia 1 0
    ASTN2 Genopedia 1 0
    FMO1 Genopedia 1 0
    FMO3 Genopedia 1 0
    CRTC1 Genopedia 1 0
    DICER1 Genopedia 1 0
    NOMO1 Genopedia 1 0
    HARS2 Genopedia 1 0
    HEY1 Genopedia 1 0
    CASP14 Genopedia 1 0
    SSBP2 Genopedia 1 0
    ALOX5 Genopedia 1 0
    Egfr Genopedia 1 0
    Erbb2 Genopedia 1 0
    Kras Genopedia 1 0
    IL27 Genopedia 1 0
    GNAI3 Genopedia 1 0
    GNAQ Genopedia 1 0
    ABO Genopedia 1 0
    P2RY8 Genopedia 1 0
    GRIK4 Genopedia 1 0
    GRIN2B Genopedia 1 0
    SETD2 Genopedia 1 0
    NR3C1 Genopedia 1 0
    GRM1 Genopedia 1 0
    EFEMP2 Genopedia 1 0
    H2AFX Genopedia 1 0
    TRPM5 Genopedia 1 0
    RPA4 Genopedia 1 0
    NENF Genopedia 1 0
    HLA-DQA1 Genopedia 1 0
    HARS Genopedia 1 0
    HFE Genopedia 1 0
    ANXA5 Genopedia 1 0
    HIC1 Genopedia 1 1
    ICAM1 Genopedia 1 0
    HLA-DRB3 Genopedia 1 0
    HNF4A Genopedia 1 0
    HOXC8 Genopedia 1 0
    APC Genopedia 1 0
    HRAS Genopedia 1 0
    IL12A Genopedia 1 0
    IL5RA Genopedia 1 0
    IL6 Genopedia 1 0
    IL7 Genopedia 1 0
    IL8 Genopedia 1 0
    AQP1 Genopedia 1 0
    IL16 Genopedia 1 0
    INHBC Genopedia 1 0
    AR Genopedia 1 0
    ITGA5 Genopedia 1 0
    ITGAL Genopedia 1 0
    ITGAV Genopedia 1 0
    ITGB1 Genopedia 1 0
    GEN1 Genopedia 1 0
    FAS Genopedia 1 0
    IL1A Genopedia 1 0
    IL1B Genopedia 1 0
    IL2 Genopedia 1 0
    FASLG Genopedia 1 0
    IGF1R Genopedia 1 0
    IGF2 Genopedia 1 0
    IGF2R Genopedia 1 0
    IFNA2 Genopedia 1 0
    IFNAR1 Genopedia 1 0
    IFNAR2 Genopedia 1 0
    IRGM Genopedia 1 0
    IFNG Genopedia 1 0
    IFNGR1 Genopedia 1 0
    ATP12A Genopedia 1 0
    NFKB1 Genopedia 1 0
    NOTCH1 Genopedia 1 0
    SERPINE1 Genopedia 1 0
    IL22 Genopedia 1 0
    PAK3 Genopedia 1 0
    PAX3 Genopedia 1 0
    PAX7 Genopedia 1 0
    PBX1 Genopedia 1 0
    ATP2B1 Genopedia 1 0
    NTRK2 Genopedia 1 0
    NUP98 Genopedia 1 0
    MPO Genopedia 1 0
    MRE11A Genopedia 1 0
    RNR1 Genopedia 1 0
    COX1 Genopedia 1 0
    MYCN Genopedia 1 0
    MYH11 Genopedia 1 0
    TRNS1 Genopedia 1 0
    MUT Genopedia 1 0
    MUTYH Genopedia 1 0
    SMAD3 Genopedia 1 0
    SMAD6 Genopedia 1 0
    STS Genopedia 1 0
    MAP2 Genopedia 1 0
    MBL2 Genopedia 1 0
    MC1R Genopedia 1 0
    MC4R Genopedia 1 0
    MDK Genopedia 1 0
    C10orf114 Genopedia 1 0
    LOX Genopedia 1 0
    LPO Genopedia 1 0
    MLL Genopedia 1 0
    MET Genopedia 1 0
    ITPR3 Genopedia 1 0
    JAK2 Genopedia 1 0
    ARCN1 Genopedia 1 0
    GSTK1 Genopedia 1 0
    KCNA4 Genopedia 1 0
    KCND2 Genopedia 1 0
    KCNH1 Genopedia 1 0
    KCNJ15 Genopedia 1 0
    KCNK1 Genopedia 1 0
    KIR2DL4 Genopedia 1 0
    KIR3DL2 Genopedia 1 0
    KRT5 Genopedia 1 0
    SLC9A4 Genopedia 1 0
    FEZF1 Genopedia 1 0
    CASP9 Genopedia 1 0
    RAD54L Genopedia 1 0
    MAML2 Genopedia 1 0
    MAP1LC3A Genopedia 1 0
    NT5C1A Genopedia 1 0
    ZGPAT Genopedia 1 0
    ATG10 Genopedia 1 0
    BRIP1 Genopedia 1 0
    SPOP Genopedia 1 0
    DTNBP1 Genopedia 1 1
    MLL2 Genopedia 1 0
    HMGA2 Genopedia 1 0
    CLPTM1L Genopedia 1 0
    ST6GALNAC5 Genopedia 1 0
    ARID1A Genopedia 1 0
    AXIN1 Genopedia 1 0
    FZD7 Genopedia 1 1
    GPR101 Genopedia 1 0
    PPM1D Genopedia 1 0
    RUNX1 Genopedia 1 0
    RUNX1T1 Genopedia 1 0
    CBFB Genopedia 1 0
    VAMP8 Genopedia 1 0
    CRADD Genopedia 1 0
    CBS Genopedia 1 0
    WISP2 Genopedia 1 0
    CCT Genopedia 1 0
    USP6 Genopedia 1 0
    NMI Genopedia 1 0
    CD2 Genopedia 1 0
    ATG12 Genopedia 1 0
    EXO1 Genopedia 1 0
    AURKB Genopedia 1 0
    PTTG1 Genopedia 1 0
    NAF1 Genopedia 1 0
    KCNB2 Genopedia 1 0
    KLF4 Genopedia 1 0
    CALCA Genopedia 1 0
    NEIL1 Genopedia 1 0
    PALB2 Genopedia 1 0
    MICALL2 Genopedia 1 0
    SHFM1 Genopedia 1 0
    CALCR Genopedia 1 0
    L2HGDH Genopedia 1 0
    CWH43 Genopedia 1 0
    CTC1 Genopedia 1 0
    MYO19 Genopedia 1 0
    MUS81 Genopedia 1 0
    NUP214 Genopedia 1 0
    MLLT10 Genopedia 1 0
    CACNA1A Genopedia 1 0
    CACNA1C Genopedia 1 0
    ZNF208 Genopedia 1 0
    CACNA1S Genopedia 1 0
    TPMT Genopedia 1 0
    VHL Genopedia 1 0
    XDH Genopedia 1 0
    XPC Genopedia 1 0
    D2HGDH Genopedia 1 0
    TXN Genopedia 1 0
    UGT2B7 Genopedia 1 0
    VDR Genopedia 1 0
    C1QA Genopedia 1 0
    CDK1 Genopedia 1 0
    GAB2 Genopedia 1 0
    LRIG2 Genopedia 1 0
    ATP2C2 Genopedia 1 0
    WDR1 Genopedia 1 0
    MVP Genopedia 1 0
    CDH1 Genopedia 1 0
    RECQL4 Genopedia 1 0
    LRRC4B Genopedia 1 0
    ORMDL3 Genopedia 1 0
    SYTL3 Genopedia 1 0
    ACVR1 Genopedia 1 0
    CCNH Genopedia 1 0
    SOCS3 Genopedia 1 0
    SPAG9 Genopedia 1 0
    ATG5 Genopedia 1 0
    GAL3ST1 Genopedia 1 0
    CD68 Genopedia 1 0
    FAM131B Genopedia 1 0
    CACNA1H Genopedia 1 0
    SOX5 Genopedia 1 0
    SOX9 Genopedia 1 0
    NR2F2 Genopedia 1 0
    TGFB1 Genopedia 1 0
    TLR2 Genopedia 1 0
    OPN1SW Genopedia 1 0
    RPA3 Genopedia 1 0
    RRM1 Genopedia 1 0
    RYR2 Genopedia 1 0
    RYR3 Genopedia 1 0
    BDNF Genopedia 1 1
    SOAT1 Genopedia 1 0
    SOD1 Genopedia 1 0
    SST Genopedia 1 0
    SSTR2 Genopedia 1 0
    SSTR5 Genopedia 1 0
    STAT1 Genopedia 1 0
    STAT4 Genopedia 1 0
    ND1 Genopedia 1 0
    STAT5A Genopedia 1 0
    STAT5B Genopedia 1 0
    STAT6 Genopedia 1 0
    AURKA Genopedia 1 0
    STK11 Genopedia 1 0
    SULT1A1 Genopedia 1 0
    SYK Genopedia 1 0
    MAP3K7 Genopedia 1 0
    TAL1 Genopedia 1 0
    TBP Genopedia 1 0
    HNF1A Genopedia 1 0
    TCF3 Genopedia 1 0
    TCF7 Genopedia 1 0
    TCN2 Genopedia 1 0
    SCN1B Genopedia 1 0
    SCN3A Genopedia 1 0
    SCN5A Genopedia 1 0
    SCN9A Genopedia 1 0
    SDHA Genopedia 1 0
    SDHB Genopedia 1 0
    SDHC Genopedia 1 0
    SDHD Genopedia 1 1
    PRDM14 Genopedia 1 0
    SEL1L Genopedia 1 0
    CDH23 Genopedia 1 0
    LRRC4 Genopedia 1 0
    CRLF2 Genopedia 1 0
    SFRP1 Genopedia 1 0
    NSD1 Genopedia 1 0
    DCLRE1C Genopedia 1 0
    ATG3 Genopedia 1 0
    SHH Genopedia 1 0
    STIL Genopedia 1 0
    SLC1A2 Genopedia 1 0
    SLC8A1 Genopedia 1 0
    SLC9A1 Genopedia 1 0
    SLC9A2 Genopedia 1 0
    SLC11A1 Genopedia 1 0
    SMARCA2 Genopedia 1 0
    RAD51L1 Genopedia 1 0
    RAG1 Genopedia 1 0
    BCHE Genopedia 1 0
    RASGRF2 Genopedia 1 0
    REN Genopedia 1 0
    RBBP6 Genopedia 1 0
    ZNF350 Genopedia 1 0
    RFC1 Genopedia 1 0
    BCL6 Genopedia 1 0
    SLC5A7 Genopedia 1 0
    PROX1 Genopedia 1 0
    TRPV5 Genopedia 1 0
    PRMT8 Genopedia 1 0
    B2M Genopedia 1 0
    SLC2A4RG Genopedia 1 0
    SMARCAD1 Genopedia 1 1
    RLFP1 Genopedia 1 0
    PRKCA Genopedia 1 0
    CACNA2D3 Genopedia 1 0
    SCN3B Genopedia 1 0
    C3orf10 Genopedia 1 0
    SMOX Genopedia 1 0
    PPARA Genopedia 1 0
    UGT1A1 Genopedia 1 0
    ZNF410 Genopedia 1 0
    RAB27A Genopedia 1 0
    RAC1 Genopedia 1 0
    RAC2 Genopedia 1 0
    RAD23B Genopedia 1 0
    MAPK1 Genopedia 1 0
    MAPK3 Genopedia 1 0
    MAP2K1 Genopedia 1 1
    MAP2K3 Genopedia 1 0
    AICDA Genopedia 1 0
    PTGS2 Genopedia 1 0
    MIR499 Genopedia 1 0
    SLC12A5 Genopedia 1 0
    PTK2 Genopedia 1 0
    MIB1 Genopedia 1 0
    STIM2 Genopedia 1 0
    FOXP3 Genopedia 1 0
    PCNA Genopedia 1 0
    LEF1 Genopedia 1 0
    PDGFB Genopedia 1 0
    NCF2 Genopedia 1 0
    NCF4 Genopedia 1 0
    PIK3C2G Genopedia 1 0
    PGR Genopedia 1 0
    PDGFRB Genopedia 1 0
    SUFU Genopedia 1 0
    WWOX Genopedia 1 0
    ATG16L1 Genopedia 1 0
    NEIL3 Genopedia 1 0
    PPP3CA Genopedia 1 0
    SLC39A9 Genopedia 1 0
    IMPACT Genopedia 1 0
    IL17RB Genopedia 1 0
    CHRNA9 Genopedia 1 0
    SLC39A4 Genopedia 1 0
    BTBD2 Genopedia 1 0
    POLB Genopedia 1 0
    POLD1 Genopedia 1 0
    POLE Genopedia 1 0
    POMC Genopedia 1 0
    PIK3CD Genopedia 1 0
    PIK3CG Genopedia 1 0
    PIK3R1 Genopedia 1 0
    PLAG1 Genopedia 1 0
    PLAUR Genopedia 1 0
Note: The number of publications displayed in this table will differ from the number displayed in the HuGE Literature Finder as the number in Phenopedia reflects only the indexed disease term, but the number in the HuGE Literature Finder reflects all text searches of the disease term including the indexed term.
TOP